明朝以前都没有帝王庙这个机构，在朱元璋建立明朝之后才在首都进行了修建，由于他个人的原因，在帝王庙里面供奉的皇帝都是立下很多功劳的，能够在历史上有准确记载而且各方面都很出色的北京烧纸牌位祭拜。除了上古时代需要要供奉的三皇五帝之外，其他的皇帝都通过精挑细选才进行供奉。自从朱元璋修建了帝王庙之后，后人都会去进行祭拜，一直到明成祖统治的时候。
当时的历代帝王庙中，有一个很矛盾的人存在，那就是忽必烈北京烧纸牌位祭拜。忽必烈到底有多厉害，想必就不用我多说了吧。他能够率领蒙古铁骑，在当时无人可挡。更是能够建立强大的大元，大元在那时的国际地位可是很高的，而且版图也很大。哪怕是在今天，有像康熙、乾隆这样的圣君忽必烈也绝对是排的上号的。他能被朱元璋收入帝王庙，情理之中。
嘉靖没有意识到这是自己的问题，反而却恨上北方的蒙古北京烧纸牌位祭拜。在嘉靖二十四年，在祭祀历代帝王庙的时候，嘉靖积攒多年的怒火终于爆发，指着忽必烈的牌位愤怒不满。只不过，这种自欺欺人，掩耳盗铃的态度并没有太多用。又过了五年，在嘉靖二十九年，他痛恨的俺答汗竟然率军突破长城，杀到北京城下，给自作聪明的嘉靖皇帝一个响亮的耳光。